Un sistema di elettroforesi è costituito da due componenti principali: un alimentatore e una camera di elettroforesi. L'alimentatore fornisce energia.La "potenza", in questo caso, è l'elettricità.L'elettricità proveniente dall'alimentatore scorre, in una direzione, da un'estremità all'altra della camera di elettroforesi.Il catodo e l'anodo della camera sono ciò che attrae le particelle con carica opposta.
All'interno della camera dell'elettroforesi si trova un vassoio, più precisamente un vassoio di colata.Il vassoio di colata è composto dalle seguenti parti: lastra di vetro che va sul fondo del vassoio di colata.Il gel viene tenuto nel vassoio di colata.Il "pettine" è proprio come il suo nome. Il pettine viene posizionato nelle fessure sul lato del vassoio di colata. Viene inserito nelle fessure PRIMA che venga versato il gel caldo e fuso.Dopo che il gel si è solidificato, il pettine viene estratto.I "denti" del pettine lasciano piccoli fori nel gel che chiamiamo "pozzetti".I pozzetti vengono realizzati quando il gel caldo e fuso si solidifica attorno ai denti del pettine.Il pettine viene estratto dopo che il gel si è raffreddato, lasciando i pozzetti.I pozzetti forniscono un posto dove mettere le particelle che desideri testare.Una persona deve stare molto attenta a non disturbare il gel durante il caricamento delle particelle.Rompere o rompere il gel probabilmente influenzerà i risultati.